Soñando proteínas in silico. Demostrándolas en el laboratorio.
Diseño y valido proteínas para descubrimiento antimicrobiano y terapia génica, traduciendo ideas a nivel de secuencia en evidencia experimental.
Hasta que la resistencia a los antibióticos deje de ganarnos terreno.
De modelos de lenguaje de proteínas a modelos de ratón.
Investigador, CMRI Sídney · 20+ publicaciones · 300+ citas · 2 patentes
Children's Medical Research Institute, Sídney
Investigador
Construimos una plataforma computacional para el descubrimiento de péptidos antimicrobianos —de predicciones con modelos de lenguaje de proteínas a validación preclínica en modelos de ratón— y extendimos el enfoque a la ingeniería de cápsides de AAV para terapia génica.
Competencias principales
Investigador predoctoral
UAB e IRTA, Barcelona
Investigador de posgrado
University of California, Irvine
01. Trabajos seleccionados
Ingeniería de proteínas desde el diseño computacional hasta la validación preclínica, entre el descubrimiento antimicrobiano y la terapia génica.
02. La historia
Encontrando la señal terapéutica en un mar de ruido biológico.
Tres países, tres laboratorios, una obsesión: convertir la secuencia en terapia.
Me formé en Biotecnología en la UAB, hice un máster en Ingeniería Biomédica en UC Irvine y volví a la UAB para un doctorado en el que diseñamos proteínas antimicrobianas de principio a fin —del diseño de secuencia a la producción recombinante y los ensayos funcionales—. De esa etapa salieron dos patentes y cuatro artículos como primer autor.
En el CMRI de Sídney construimos una plataforma para analizar millones de secuencias y descubrir cientos —a veces miles— de nuevos péptidos antimicrobianos. Con modelos de lenguaje de proteínas y los últimos avances en IA, probamos esas predicciones tanto en el laboratorio como en modelos preclínicos. En paralelo, aplicamos IA generativa a la ingeniería de proteínas para diseñar cápsides de AAV para terapia génica.
Competencias principales
Modelos de lenguaje de proteínas
ESM-2, ProtTrans, análisis de secuencias con pLM
Ingeniería de cápsides AAV
Evolución dirigida, librerías de cápsides, ingeniería de tropismo
Python y ciencia de datos
PyTorch, scikit-learn, pandas, pipelines de datos
Descubrimiento antimicrobiano
Diseño de péptidos, ensayos MIC, eficacia in vivo
Validación preclínica
Modelos de ratón, farmacocinética, toxicología
Biología molecular
Clonaje, expresión proteica, ensayos funcionales
Investigador
Children's Medical Research Institute, SídneyConstruimos una plataforma computacional para el descubrimiento de péptidos antimicrobianos —de predicciones con modelos de lenguaje de proteínas a validación preclínica en modelos de ratón— y extendimos el enfoque a la ingeniería de cápsides de AAV para terapia génica.
Investigador predoctoral
UAB e IRTA, BarcelonaDiseñamos proteínas antimicrobianas desde cero —clonaje, producción recombinante, ensayos funcionales—. Dos patentes y cuatro artículos como primer autor, ocho en total.
Investigador de posgrado
University of California, IrvineRastreamos la dinámica del receptor de estrógenos en células vivas con microscopía de fluorescencia de molécula única y análisis cuantitativo de imagen.
El código no mata bacterias. Pero me dice dónde apuntar.
Uniendo computación y biología. 20+ publicaciones, 300+ citas y 2 patentes en descubrimiento de fármacos antimicrobianos e ingeniería de proteínas.
Investigador, CMRI Sídney · 20+ publicaciones · 300+ citas · 2 patentes